最新!研究發(fā)現(xiàn):華南海鮮市場非新冠病毒發(fā)源地,去年11月下旬或已人傳人
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小秋于 2020/02/23 17:20:31 發(fā)布
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來源:微信公眾號(hào)
作者:半島都市報(bào)
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最新!研究發(fā)現(xiàn):華南海鮮市場非新冠病毒發(fā)源地,去年11月下旬或已人傳人
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據(jù)中國科學(xué)院西雙版納熱帶植物園官方網(wǎng)站消息,該園聯(lián)合華南農(nóng)業(yè)大學(xué)和北京腦科中心,收集了全球共享到GISAID EpiFluTM數(shù)據(jù)庫中覆蓋四大洲12個(gè)國家的93個(gè)新冠病毒樣本基因組數(shù)據(jù)(截至2月12日),通過全基因組數(shù)據(jù)解析發(fā)現(xiàn):武漢華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其他地方傳入,而且病毒可能在去年12月初,甚至11月下旬已開始人際傳播。
93個(gè)樣本包含58種單倍型,演化關(guān)系顯示,單倍型H13和H38是比較“古老的”單倍型,通過一個(gè)中間載體(mv1,可能是祖先單倍型,也可能是來自中間宿主或“零號(hào)病人”)與蝙蝠冠狀病毒RaTG13關(guān)聯(lián),并通過單倍型H3衍生出單倍型H1。研究人員稱,與華南海鮮市場有關(guān)聯(lián)的患者樣品單倍型都是H1及其衍生單倍型H2,H8-H12,而一份武漢樣品單倍型H3與華南海鮮市場無關(guān)。可見,華南海鮮市場的新冠病毒是從其他地方傳入,再在市場發(fā)生快速傳播并蔓延。另根據(jù)病患發(fā)病時(shí)間記錄和種群擴(kuò)張時(shí)間推斷,也印證了華南海鮮市場不是病毒發(fā)源地的推論?!?/span>
△新冠病毒單倍型的樣品采集時(shí)間情況。紅色圈的樣品是確認(rèn)與華南海鮮市場有關(guān);藍(lán)色圈的樣本確認(rèn)與海鮮市場無關(guān)。此外,研究人員對(duì)H13和H38的病毒樣品溯源發(fā)現(xiàn),分別來自深圳的病患(廣東首例)和美國華盛頓州的病患(美國首例)。他們的旅行記錄表明都是2019年12月底至2020年1月初在武漢被感染。現(xiàn)有武漢樣本中沒有檢測(cè)到H13和H38單倍型。新冠病毒可能在去年12月初,甚至11月下旬已開始人際傳播
研究還顯示,新冠病毒在2月12日前發(fā)生過2次明顯種群擴(kuò)張:一次是2019年12月8日,該結(jié)果暗示病毒可能在12月初,甚至11月下旬已開始人際傳播,隨后在華南海鮮市場加快;研究推算今年2月份之前的種群擴(kuò)張時(shí)間在1月6日,這個(gè)可能與元旦假期有關(guān)聯(lián)。 華南海鮮批發(fā)市場資料圖。張暢 攝
現(xiàn)在擴(kuò)散的病例至少來自三個(gè)途徑
為了能夠細(xì)分來源,研究人員將58種單倍型分成了五組,采用標(biāo)準(zhǔn)是3個(gè)中心(古老超級(jí)傳播者)單倍型(H1,H3和H13)和2個(gè)新的超級(jí)傳播者單倍型(H56和mv2)。以此鑒別出廣東的病毒可能有三個(gè)來源,重慶和臺(tái)灣的病毒有兩個(gè)來源。其中,廣東深圳一家人在早期就通過人傳人進(jìn)行了傳播。有較多樣本的澳大利亞、法國、日本和美國,他們的患者感染源至少有兩個(gè),尤其是美國包括了五個(gè)來源。

△新型冠狀病毒58種單倍型的演化關(guān)系和地理分布格局(A,B),單倍型之間的可能演化關(guān)系(C),以及新型冠狀病毒的可能傳播和擴(kuò)散路線(D)。A和B圓圈中的數(shù)據(jù)是樣本數(shù)量。
非常值得關(guān)注的是H56這個(gè)超級(jí)傳播者單倍型,它同時(shí)是澳大利亞、法國和美國,以及我國臺(tái)灣患者的傳染源。其他國家患者因?yàn)闃悠繁容^少,大多數(shù)的來源比較單一,他們除了是武漢旅游輸入或在武漢感染外,有一些人可能是在廣東、新加坡等地被感染。研究人員還發(fā)現(xiàn),新冠病毒基因組還沒有發(fā)生重組事件。研究人員稱,這項(xiàng)研究提到單倍型演化關(guān)系分析方法可以結(jié)合到傳染病學(xué)研究中,對(duì)于尋找傳染源,以及精確的傳播和擴(kuò)散方向能提供非常重要的信息。◆編輯:小金剛 校對(duì):高迎迎 審核:孫瞳